Esto es mas bien un resumen de las instrucciones que nos deja el mismo creador de Xdebug en su pagina (http://xdebug.org/docs/install) mas un par de cosas que da por entendido que debemos saber

1) Lo primero es bajarse el código fuente de la ultima versión de Xdebug (la 2.1 es la ultima al día de la fecha)

http://xdebug.org/files/xdebug-2.1.0.tgz

2) Descompriman el archivo en una carpeta cualquiera

De acá en mas solo nos queda compilar configurar y probar:

3) Lancen el siguiente comando para asegurarse que tienen instaladas las librerías de desarrollo de php5 que son necesarias para poder compilar Xdebug:

apt-get install php5-dev

4) Entren en la carpeta por medio de la consola:

cd /ruta/a/la/carpeta/donde/descomprimiste/los/archivos/fuente/de/xdebug/xdebug-2.1.0/

5) Lanzar el comando phpize

phpize

6) Lanzar:

./configure --enable-xdebug
make
sudo make install

Al final del infierno de outputs de salen en la consola van a apreciar que se dibuja un recuadro como el que se ve en la siguiente imagen:

Bueno, justo encima de ese recuadro pueden ver que dice algo como “Installing shared extensions: /usr/lib/php5/20090626+lfs/“. Copien esa ruta.

Ya esta instalado Xdebug. Configuremos lo XD.

7) Editemos php.ini

sudo gedit /etc/php5/apache2/php.ini

Y en la ultima linea del archivo pequen lo siguiente:

zend_extension="/usr/lib/php5/20090626+lfs/xdebug.so"
xdebug.remote_enable=1
xdebug.remote_handler=dbgp
xdebug.remote_mode=req
xdebug.remote_host=127.0.0.1
xdebug.remote_port=9000

NOTA: en la linea que dice “zend_extension” reemplacen la ruta del ejemplo por la que copiaron en el paso 6

8) Listo! todo en teoría funciona. para comprobarlo abran el IDE al que le tengan mas bronca y configurenlo!